Thesis

1. Josquin Harrison. Medical imaging, shapes and statistics for stroke prediction in atrial fibrillation. Theses, Université Côte d'Azur, June 2024. Keyword(s): Shape statistics, Cerebrovascular accident, Machine learning, Medical imaging, Atrial fibrillation, Statistiques de formes, Accident vasculaire cérébral, Apprentissage, Imagerie medicale, Fibrillation atriale. [bibtex-entry]



2. Huiyu Li. Data exfiltration and anonymization of medical images based on generative models. Theses, Université Côte d'Azur, November 2024. Keyword(s): Data exfiltration attack, Privacy and security, Latent code optimization, Identity-utility extraction, Medical image anonymization, Steganography, Images compression, Attaque d'exfiltration de données, Compression d'images, Stéganographie, Anonymisation d'images médicales, Extraction d'identité-utilité, Optimisation du code latent, Confidentialité. [bibtex-entry]



3. Hari Sreedhar. Thyrosonics : learning-based detection and classification of thyroid nodules from ultrasound images. Theses, Université Côte d'Azur, October 2024. Keyword(s): Thyroid cancer, Machine learning, Medical imaging, Cancer de la thyroïde, Apprentissage automatique, Imagerie médicale. [bibtex-entry]



4. Riccardo Taiello. Privacy-preserving machine learning for large-scale collaborative healthcare data analysis. Theses, Université Côte d'Azur, September 2024. Keyword(s): Federate learning, Privacy enhancing technologies, Security and privacy, Apprentissage fédéré, Technologies de renforcement de la confidentialité, Sécurité et confidentialité. [bibtex-entry]

1. Gaëtan Desrues. Personalised 3D electromechanical models of the heart for cardiac resynchronisation therapy planning in heart failure patients. Theses, Université Côte d'Azur, March 2023. Keyword(s): Biomechanics, Artificial intelligence, Finite element method, Cardiac electrophysiology, CRT, ECG, Digital twin, Patient-specific simulation, Intelligence artificielle, Méthode des éléments finis, Biomécanique, Électrophysiologie cardiaque, CRT, ECG, Jumeau numérique, Simulation personnalisée. [bibtex-entry]



2. Yann Fraboni. Reliability and robustness of federated learning in practical applications. Theses, Université Côte d'Azur, May 2023. Keyword(s): Heterogeneous data, Bias, Distributed optimization, Privacy, Federated learning, Biais, Optimisation distribuée, Protection des données, Données hétérogènes, Apprentissage fédéré. [bibtex-entry]



3. Dimitri Hamzaoui. AI-based diagnosis of prostate cancer from multiparametric MRI. Theses, Université Côte d'Azur, June 2023. Keyword(s): Artificial intelligence, Medical imaging, Consensus, Segmentation, Inter-expert variability, Prostate-cancer, Machine learning, Intelligence artificielle, Imagerie médicale, Consensus, Segmentation, Variabilité inter-expert, Prostate-cancer, Apprentissage profond. [bibtex-entry]



4. Etrit Haxholli. Scalable and flexible density estimation for complex data distributions. Theses, Université Côte d'Azur, October 2023. Keyword(s): Density estimation, Cross-tail-estimation, Peaks-over-threshold, Loss function distributions, Tail modelling, Extreme value theorie, Diffusion models, Normalizing flows, Estimation de la densité, Flux de normalisation, Modèles de diffusion, Théorie des valeurs extrêmes, Modélisation de la queue, Distributions de la fonction de perte, Pics-au-dessus-du-seuil, Estimation de la queue croisée. [bibtex-entry]



5. Victoriya Kashtanova. Learning cardiac electrophysiology dynamics with PDE-based physiological constraints for data-driven personalised predictions. Theses, Université Côte d'Azur, June 2023. Keyword(s): Simulations, PDE, Model personalisation, Cardiac electrophysiology, Deep learning, Physics-based learning, Simulations, EDP, Personnalisation de modèle, Electrophysiologie cardiaque, Apprentissage profond, Apprentissage basé sur la physique. [bibtex-entry]



6. Elodie Maignant. Barycentric embeddings for geometric manifold learning : with application to shapes and graphs. Theses, Université Côte d'Azur, December 2023. Keyword(s): Geometric learning, Riemannian and barycentric geometry, Manifold learning, Quotient manifolds, Kendall shape spaces, Statistical graph analysis, Espaces de formes de Kendall, Analyse statistique de graphes, Variétés quotient, Apprentissage de variétés, Géométrie riemannienne et barycentrique, Apprentissage géométrique. [bibtex-entry]



7. Morten Akhoj Pedersen. Riemannian and sub-riemannian methods for dimension reduction. Theses, Université Côte d'Azur ; Kobenhavns universitet, November 2023. Keyword(s): Sub-Riemannsk geometri, Maskinlaering, Matematisk statistik, Differentialgeometry, Geometrisk statistik, Riemannsk geometri, Mathematical statistics, Geometric statistics, Sub-riemannian geometry, Differential geometry, Géometrie riemannienne, Machine learning, Apprentissage automatique, Géometrie riemannienne, Géométrie différentielle, Statistique mathématique, Géometrie sous-riemannienne, Statistiques géométriques. [bibtex-entry]



8. Santiago Smith Silva Rincon. Federated Learning of Biomedical Data in Multicentric Imaging Studies. Theses, UCA, Inria, July 2023. Keyword(s): meta-analysis, FedComBat, random effect models, Bayesian optimization, Fed-BioMed, mega-analysis, data harmonization, medical imaging, GDPR, data protection, healthcare, federated learning, CCPA, FedComBat, modèles à effets aléatoires, optimisation bayésienne, Fed-BioMed, méganalyse, méta-analyse, harmonisation des données, imagerie médicale, CCPA, RGPD, protection des données, santé, apprentissage fédéré. [bibtex-entry]



9. Paul Tourniaire. AI-based selection of imaging and biological markers predictive of therapy response in lung cancer. Theses, Université Côte d'Azur, June 2023. Keyword(s): Digital pathology, Multiple instance learning, Mixed supervision, Deep learning, Survival analysis, Lung cancer, Immunotherapy, Histopathologie numérique, Immunothérapie, Cancer du poumon, Analyse de survie, Apprentissage profond, Supervision mélangée, Apprentissage multi-instance. [bibtex-entry]



10. Yingyu Yang. Automatic analysis of cardiac function with artificial intelligence : multimodal approach for portable echocardiographic devices. Theses, Université Côte d'Azur, December 2023. Keyword(s): Deep learning with uncertainty, Multi-modal learning, Electrocardiogram decomposition, Echocardiography motion tracking, Echocardiography segmentation, Deep learning, Cardiac function analysis, Analyse de la fonction cardiaque, Apprentissage profond, Segmentation de l'échocardiographie, Suivi du mouvement en échocardiographie, Décomposition de l'électrocardiogramme, Apprentissage multimodal, Apprentissage profond avec incertitude. [bibtex-entry]

1. Hind Dadoun. AI-based analysis of abdominal ultrasound images to support medical diagnosis. Theses, Université Côte d'Azur, December 2022. Keyword(s): Natural language processing, Semi-supervised learning, Self-supervised learning, Object detection, Bayesian learning, Ultrasound imaging, Traitement du langage naturel, Apprentissage semi-supervisé, Apprentissage auto-supervisé, Détection d'objets, Apprentissage bayésien, Imagerie ultrasonore. [bibtex-entry]



2. Florent Jousse. Statistical modeling of face morphology for dermatology and plastic surgery. Theses, Université Côte d'Azur, September 2022. Keyword(s): Disentangled learning, Partial least squares, Geodesic kernel, Face modeling, Shape registration, Statistical shape modeling, Moindres carrés partiels, Démêlage de représentations, Noyau géodésique, Modélisation du visage, Recalage de formes, Modélisation statistique de forme. [bibtex-entry]



3. Buntheng Ly. Deep learning on large clinical databases for image-based predictions of cardiac arrhythmias. Theses, Université Côte d'Azur, December 2022. Keyword(s): Cardiac arrhythmia, Explainable learning, Artificial intelligence, Multi-modality, Cardiac imaging, Multi-modalité, Imagerie cardiaque, Modèle explicable, Intelligence artificielle, Arythmie cardiaque. [bibtex-entry]



4. Yann Thanwerdas. Riemannian and stratified geometries on covariance and correlation matrices. Theses, Université Côte d'Azur, May 2022. Keyword(s): Families of metrics, Stratified spaces, Geodesics, Correlation matrices, Covariance matrices, Riemannian geometry, Espaces stratifiés, Géodésiques, Familles de métriques, Matrices de corrélation, Matrices de covariance, Géométrie riemannienne. [bibtex-entry]

1. Clément Abi Nader. Modelling and simulating the progression of Alzheimer's disease through the analysis of multi-modal neuroimages and clinical data. Theses, Université Côte d'Azur, June 2021. Keyword(s): Dynamical systems, Variational autoencoder, Gaussian processes, Machine learning, Positron emission tomography, Magnetic resonance imaging, Clinical trials, Alzheimer's disease, Auto-encodeur variationnel, Systèmes dynamiques, Processus gaussiens, Apprentissage automatique, Tomographie par émission de positons, Imagerie par résonance magnétique, Essais cliniques, Maladie d'Alzheimer. [bibtex-entry]



2. Luigi Antelmi. Statistical learning on heterogeneous medical data with bayesian latent variable models : application to neuroimaging dementia studies. Theses, Université Côte d'Azur, July 2021. Keyword(s): High dimensional data, Multi-task learning, Variational autoencoder, Positron emission tomography, Magnetic resonance imaging, Neuro-imaging, Alzheimer's disease, Maladie d'Alzheimer, Neuro-imagerie, Imagerie par résonnance magnétique, Tomographie par émission de positrons, Auto-encodeur variationnel, Apprentissage multi-tâche, Données de haute dimension, Données multimodales. [bibtex-entry]



3. Benoît Audelan. Probabilistic segmentation modelling and deep learning-based lung cancer screening. Theses, Université Côte d'Azur, July 2021. Keyword(s): Medical imaging, Lung cancer, Deep learning, Machine learning, Artificial intelligence, Image segmentation, Cancer du poumon, Apprentissage profond, Apprentissage artificiel, Intelligence artificielle, Segmentation d'images, Imagerie médicale. [bibtex-entry]



4. Tania Bacoyannis. Deep probabilistic generative model for the inverse problem of electrocardiography. Theses, Université Côte d'Azur, December 2021. Keyword(s): Computational modelling, Inverse problem, Generative model, Electrocardiography, Deep learning, Data processing, Cardiac activation, Traitement de données, Problème inverse, Modèle génératif, Modélisation numérique, Électrocardiographique, Apprentissage profond, Activation cardiaque. [bibtex-entry]



5. Jaume Banus. Heart & Brain. Linking cardiovascular pathologies and neurodegeneration with a combined biophysical and statistical methodology. Theses, Université Côte d'Azur, May 2021. Keyword(s): Variational autoencoder, Personalisation, Gaussian process, Machine learning, Lumped models, Neurodegeneration, Cardiovascular modelling, Medical imaging, Imagerie médicale, Personnalisation, Processus Gaussien, Autoencodeur variationnel, Apprentissage automatique, Modèles regroupés, Neurodégénérescence, Modélisation cardiovasculaire. [bibtex-entry]



6. Nicolas Guigui. Computational methods for statistical estimation on Riemannian manifolds and application to the study of the cardiac deformations. Theses, Université Côte d'Azur, November 2021. Keyword(s): Differential geometry, Computational anatomy, Geometric statistics, Géométrie différentielle, Anatomie computationnelle, Statistiques géométriques. [bibtex-entry]



7. Zihao Wang. Deep generative learning for medical data processing, analysis and modeling : application to cochlea CT imaging. Theses, Université Côte d'Azur, September 2021. Keyword(s): Deep learing, Stochastic flow, Bayesian learning, Generative learning, Apprentissage profond, Flux stochastique, Apprentissage bayésien, Apprentissage génératif. [bibtex-entry]

1. Nicolas Cedilnik. Image-based Personalised Models of Cardiac Electrophysiology for Ventricular Tachycardia Therapy Planning. Theses, Université Côte d'Azur, December 2020. Keyword(s): Computed tomography, Cardiac electrophysiology, Model personalisation, Ventricular tachycardia, Imagerie tomodensitométrique, Électrophysiologie cardiaque, Personnalisation de modèles, Tachycardie ventriculaire. [bibtex-entry]



2. Julian Krebs. Robust medical image registration and motion modeling based on machine learning. Theses, Université Côte d'Azur, June 2020. Keyword(s): Sudden Cardiac Death Risk, Varitiaonal Autoencoder, Machine Learning, Motion Modeling, Medical Image Registration, Apprentissage profond, Modélisation du mouvement, Recalage d'images médicales. [bibtex-entry]



3. Marco Lorenzi. Modelling pathological processes from heterogeneous and high-dimensional biomedical data. Accreditation to supervise research, UCA, January 2020. Keyword(s): genetics, federated learning, Alzheimer's disease, machine learning, brain, medical imaging, statistical learning, apprentissage statistique, imageie medicale, cerveau, apprentissage par ordinateurs, maladie d'Alzheimer, apprentissge féderé genetics. [bibtex-entry]



4. Wen Wei. Learning brain alterations in multiple sclerosis from multimodal neuroimaging data. Theses, Université Côte d'Azur, June 2020. Keyword(s): Missing Modalities, Missing MRI Sequences, Image Synthesis, Generative Adversarial Network (GAN), Convolutional Neural Networks (CNN), Deep Learning, Brain Alterations, MR Imaging, PET Imaging, Multiple Sclerosis, Modalités Manquantes, Séquences IRM Manquantes, Synthèse d'images, Réseaux Antagonistes Génératifs (GAN), Réseau de Neurones Convolutifs (CNN), Apprentissage en profondeur, Altérations cérébrales, IRM, TEP, Sclérose en Plaques. [bibtex-entry]

1. Shuman Jia. Population-based models of shape, structure, and deformation in atrial fibrillation. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), December 2019. Keyword(s): Atrial fibrillation, Parallel transport, Statistical shape analysis, Fat, Segmentation, Cardiac image analysis, Transport parallèle, Analyse statistique des formes, Graisse, Segmentation, Fibrillation auriculaire, Analyse d'images cardiaques. [bibtex-entry]



2. Pawel Mlynarski. Deep learning for segmentation of brain tumors and organs at risk in radiotherapy planning. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), November 2019. Keyword(s): MRI, Organs at risk, Brain tumor, Radiotherapy, Semi-supervised learning, Convolutional Neural Networks, Organes à risque, Tumeur cérébrale, Radiothérapie, IRM, Apprentissage semi-supervisé, Réseau neuronal convolutif. [bibtex-entry]



3. Raphaël Sivera. Modeling and measuring the brain morphological evolution using structural MRI in the context of neurodegenerative diseases. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), November 2019. Keyword(s): Multivariate statistical analysis, Longitudinal models, MRI, Alzheimer's disease, Aging, Morphometry, Statistiques multivariées, Modèles longitudinaux, IRM, Maladie d'Alzheimer, Vieillissement, Morphométrie. [bibtex-entry]



4. Qiao Zheng. Deep learning for robust segmentation and explainable analysis of 3d and dynamic cardiac images. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), March 2019. Keyword(s): Cine MRI, Cardiac analysis, Cardiac segmentation, Deep learning, Ciné-IRM, Analyse cardiaque, Segmentation cardiaque, Apprentissage profond. [bibtex-entry]

1. Pamela Moceri. From normal right ventricle to pathology : shape and function analysis with different loading conditions using imaging and modelling. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), January 2018. Keyword(s): Right ventricle, Medical imaging, Echocardiography, Strain imaging, Fonction ventriculaire droite, Imagerie médicale, Échocardiographie, Modélisation. [bibtex-entry]

1. Thomas Demarcy. Segmentation and study of anatomical variability of the cochlea from medical images. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), July 2017. Keyword(s): Cochlea, Segmentation, Shape model, Shape variability, Cochlée, Segmentation, Modèle de forme, Variabilité anatomique. [bibtex-entry]



2. Loïc Devilliers. Consistency of statistics in infinite dimensional quotient spaces. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), November 2017. Keyword(s): Frechet mean, Quotient space, Template estimation, Moyenne de Fréchet, Espace quotient, Estimation de template. [bibtex-entry]



3. Sophie Giffard-Roisin. Non-invasive personalisation of cardiac electrophysiological models from surface electrograms. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), December 2017. Keyword(s): Cardiac Electro-physiology Model, Machine learning, Simulated database, Inverse problem, Personalisation, ECG imaging, Problème inverse, Base de données simulée, Apprentissage machine, Modèle électrophysiologique cardiaque, Personnalisation, Imagerie ECG. [bibtex-entry]



4. Roch Molléro. Robust personalisation of 3D electromechanical cardiac models. Application to heterogeneous and longitudinal clinical databases. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), December 2017. Keyword(s): Cardiax modelling, Parameter estimation, Multifidelity methods, Prior probabilities, Modélisation cardiaque, Estimation de paramètres, Méthodes multi-échelles, Probabilités a priori. [bibtex-entry]



5. Marc-Michel Rohé. Reduced representation of segmentation and tracking in cardiac images for group-wise longitudinal analysis. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), July 2017. Keyword(s): Longitudinal analysis, Statistical model reduction, Deep learning, Non-rigid registration, Medical image analysis, Analyse longitudinale, Réduction statistique de modèle, Apprentissage profond, Recalage non-rigide, Analyse d'images médicales. [bibtex-entry]

1. Mehdi Hadj-Hamou. Beyond volumetry in longitudinal deformation-based morphometry : application to sexual dimorphism during adolescence. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), December 2016. Keyword(s): Longitudinal images, Evaluation, Volumetric methods, Non-rigid registration, Processing pipeline, Multivariate statistics, Group comparison, Sexual dimorphism, Méthodes pour la volumétrie, Dimorphisme sexuel, Comparaison de groupe, Statistiques multivariées, Chaîne de traitement, Recalage non-linéaire, Évaluation, Images longitudinales. [bibtex-entry]



2. Bishesh Khanal. Modeling and simulation of realistic longitudinal structural brain MRIs with atrophy in Alzheimer's disease. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, July 2016. Keyword(s): Biophysical modelling, Synthetic longitudinal images, Biomechanical simulation, Longitudinal MRIs simulation, Simulation of atrophy, Alzheimer's disease, Neurodegeneration, Images longitudinales synthétiques, Simulation biomécanique, Simulation d'IRM longitudinale, Simulation de l'atrophie, Modélisation biophysique, Maladie d'Alzheimer, Neurodégénérescence. [bibtex-entry]



3. Matthieu Lê. Brain tumor growth modeling : application to radiotherapy. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, June 2016. Keyword(s): Uncertainty, Segmentation, Radiotherapy, Personalization, Biophysical model, Medical imaging, Incertitude, Segmentation, Radiothérapie, Personnalisation, Modèle biophysique, Imagerie médicale. [bibtex-entry]



4. Nina Miolane. Geometric statistics for computational anatomy. Theses, COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), December 2016. Keyword(s): Statistics, Geometry, Medical imaging, Anatomy, Statistiques, Géométrie, Imagerie médicale, Anatomie. [bibtex-entry]



5. Maxime Sermesant. When Cardiac Biophysics Meets Groupwise Statistics: Complementary Modelling Approaches for Patient-Specific Medicine. Accreditation to supervise research, Université de Nice - Sophia Antipolis, June 2016. Keyword(s): machine learning, statistics, biophysics, cardiac modelling, modélisation cardiaque. [bibtex-entry]



6. Anant Suraj Vemuri. Inter-operative biopsy site relocalization in gastroscopy : application to oesophagus. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, April 2016. Keyword(s): Gastro-intestinal endoscopy, Inter-operative relocalization, Electromagnetic tracking, Suivi électromagnétique, Relocalisation préopératoire, Endoscopie gastro-intestinale. [bibtex-entry]

1. Chloé Audigier. Computational modeling of radiofrequency ablation for the planning and guidance of abdominal tumor treatment. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, October 2015. Keyword(s): Patient-Specific, Medical imaging, Pre-clinical study, Parameter estimation, Lattice Boltzmann method, Computer model, Computational fluid dynamics, Cellular necrosis, Heat transfer, Liver, RFA Modeling, Imagerie médicale, Étude préclinique, Estimation de paramètres, Méthode de Lattice Boltzmann, Modèle informatique, Mécanique des fluides, Nécrose cellulaire, Diffusion de la chaleur, Personnalisation, Foie, Modélisation d'ARF. [bibtex-entry]



2. Thomas Benseghir. Topology Preserving Vascular Registration: Application to Percutaneous Coronary Intervention. Theses, Université de Nice-Sophia Antipolis, July 2015. Keyword(s): Coronary Arteries, 3D/2D Registration, Artères Coronaires, Recalage 3D/2D. [bibtex-entry]



3. Rocìo Cabrera Lozoya. Radiofrequency ablation planning for cardiac arrhythmia treatment using modeling and machine learning approaches. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, September 2015. Keyword(s): Radiofrequency ablation planning, Local abnormal ventricular activities (LAVA), Electroanatomical mapping, Machine learning, Intracardiac electrogram modeling, Cardiac electrophysiology modeling, Activités ventriculaires anormales locales LAVA, Planification d'ablation par radiofréquence, Apprentissage automatique, Modélisation d'électrogrammes intracardiaques, Modélisation de l'électrophysiologie cardiaque. [bibtex-entry]



4. Nicolas Cordier. Multi-atlas patch-based segmentation and synthesis of brain tumor MR images. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, December 2015. Keyword(s): Modality synthesis, Medical image simulation, Probabilistic generative model, Segmentation, Glioma, Multi-atlas, Patch-based, Appariement de blocs de voxels, Synthèse de modalité, Simulation d'image médicale, Modèle génératif probabiliste, Segmentation, Gliome, Multi-atlas. [bibtex-entry]



5. Vikash Gupta. Diffusion tensor imaging of the brain : towards quantitative clinical tools. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, March 2015. Keyword(s): Clinical DTI, Super-resolution, Multimodal brain atlas, Population based statistical analysis, HIV, DTI clinique, Super-résolution, Multimodales atlas du cerveau, Analyse statistique basée sur la population, VIH. [bibtex-entry]



6. Loïc Le Folgoc. Statistical learning for image-based personalization of cardiac models. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, November 2015. Keyword(s): MCMC, Automatic relevance determination, Structured sparse bayesian learning, Non-rigid registration, Cardiac motion tracking, Inverse problem, Recalage non-rigide, MCMC, Détermination automatique, Modélisation bayésienne parcimonieuse structurée, Suivi de mouvement cardiaque, Problème inverse. [bibtex-entry]



7. Jan Margeta. Machine Learning for Simplifying the Use of Cardiac Image Databases. Theses, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, December 2015. [bibtex-entry]

1. Erin Stretton. Simulation of patient-specific glioma models for therapy planning. Theses, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, November 2014. Keyword(s): Patient-Specific, Ficher Kolmogorov Model, Medical Imaging, Computer Model, Glioma Modeling, Brain Tumor Modeling, Modélisation de Gliome, Modèlisation numérique, Modèle de Fisher Kolmogorov, Imagerie Médicale, Patient-Spécifique, Modélisation de Tumeur Cérébrale. [bibtex-entry]



2. Hugo Talbot. Interactive Patient-Specific Simulation of Cardiac Electrophysiology. Theses, Université des Sciences et Technologies de Lille, July 2014. Keyword(s): Cardiac Electrophysiology Modeling, Real-Time Simulation, Arrhythmia Modeling, Cardiac Electromechanics, Nonlinear Optimisation, Model Personalization, Endovascular Navigation, SOFA Framework, Radio- Frequency Ablation Planning, Training Simulation, Simulation Temps-Réel, Modélisation de l'Électrophysiologie Cardiaque, Framework de Simulation SOFA, Planning d'Ablation, Ablation Radio-Fréquence, Simulation d'Entrainement, Navigation Endovasculaire, Personnalisation de Modèle, Optimisation Non-linéaire, Électromécanique Cardiaque, Modélisation d'Arythmie. [bibtex-entry]

1. Marine Breuilly. Small animal 4D SPECT imaging : assessment of respiratory motion and iodide biodistribution. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, November 2013. Keyword(s): Compartmental analysis, 99mTc-pertechnetate biodistribution, Respiratory gating, Respiratory motion, Dynamic images, Small animal, SPECT, Mouvement respiratoire, Analyse compartimentale, Biodistribution du 99mTc-pertechnétate, Synchronisation respiratoire, Images dynamiques, Petit animal, TEMP. [bibtex-entry]



2. Ezequiel Geremia. Spatial random forests for brain lesions segmentation in MRIs and model-based tumor cell extrapolation. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, January 2013. Keyword(s): Cell density, Gliomas, Multiple sclerosis, Random forests, Regression, Segmentation, MRI, Gliomes, Densité cellulaire, Sclérose en plaques, Forêts aléatoires, Régression, Segmentation, IRM. [bibtex-entry]



3. Stephanie Marchesseau. Simulation de modèles personnalisés du coeur pour la prédiction de thérapies cardiaques. Theses, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, January 2013. Keyword(s): Specificity analysis, Patient-specific, Medical imaging, Computer model, Cardiac mechanics, Cardiac modeling, Etude de Spécificité, Personnalisation, Imagerie Médicale, Modèle Informatique, Mécanique Cardiaque, Modélisation Cardiaque. [bibtex-entry]



4. Kristin Mcleod. Reduced-order statistical models of cardiac growth, motion and blood flow : application to the tetralogy of Fallot heart. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, November 2013. Keyword(s): Tetralogy of Fallot, Statistical model reduction, Non-rigid registration, Medical image analysis, Tétralogie de Fallot, Modèles statistiques réduits, Recalage, Analyse d'images médicales. [bibtex-entry]



5. Adityo Prakosa. Analysis and simulation of multimodal cardiac images to study the heart function. Theses, Université Nice Sophia Antipolis, January 2013. Keyword(s): Cardiac motion tracking, Synthetic cardiac sequences, Cardiac inverse electro-kinematic learning, Problème inverse du couplage électro-cinématique, Simulation de séquences synthétiques d'images cardiaque, Suivi de mouvement cardiaque. [bibtex-entry]

1. Marco Lorenzi. Deformation-based morphometry of the brain for the development of surrogate markers in Alzheimer's disease. Ph.D. Thesis, University of Nice Sophia Antipolis, December 2012. [bibtex-entry]



2. Jatin Relan. Personalised Electrophysiological Models of Ventricular Tachycardia for Radio Frequency Ablation Therapy Planning. Ph.D. Thesis, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, June 2012. [bibtex-entry]



3. Christof Seiler. Trees on Geometrical Deformations to Model the Statistical Variability of Organs in Medical Images. Ph.D. Thesis, University of Nice Sophia Antipolis and University of Bern, September 2012. [bibtex-entry]



4. Nicolas Toussaint. Curvilinear Analysis and Approximation of Cardiac DTI In-Vivo. PhD Thesis, King's College London, July 2012. [bibtex-entry]

1. Barbara André. Smart Atlas for Endomicroscopy Diagnosis Support: A Clinical Application of Content-Based Image Retrieval. Ph.D. Thesis, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, October 2011. [bibtex-entry]



2. François Chung. Regional appearance modeling for deformable model-based image segmentation. Ph.D. Thesis, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, January 2011. [bibtex-entry]



3. Liliane Ramus. Conception et utilisation d'atlas anatomiques pour la segmentation automatique : application à la radiothérapie des cancers ORL. Thèse de sciences, Université de Nice Sophia Antipolis, Juillet 2011. [bibtex-entry]

1. Florence Billet. Assimilation de données images pour la personnalisation d'un modèle électromécanique du coeur. Thèse de sciences (PhD Thesis), Université Nice Sophia-Antipolis, July 2010. [bibtex-entry]



2. Stanley Durrleman. Statistical models of currents for measuring the variability of anatomical curves, surfaces and their evolution. Thèse de sciences (PhD Thesis), Université de Nice-Sophia Antipolis, March 2010. [bibtex-entry]



3. Romain Fernandez. Reconstruction tridimensionnelle et suivi de lignées cellulaires à partir d'images de microscopie laser : application à des tissus végétaux. Thèse de sciences, Université Montpellier 2, November 2010. [bibtex-entry]



4. Heike Hufnagel. A probabilistic framework for point-based shape modeling in medical image analysis. PhD Thesis, University of Lübeck, July 2010. [bibtex-entry]



5. Tommaso Mansi. Image-Based Physiological and Statistical Models of the Heart, Application to Tetralogy of Fallot. Thèse de sciences (PhD Thesis), Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, September 2010. [bibtex-entry]

1. Ender Konukoglu. Modeling Glioma Growth and Personalizing Growth Models in Medical Images. PhD Thesis, Université Nice Sophia-Antipolis, February 2009. [bibtex-entry]



2. Jean-Marc Peyrat. Comparison of Cardiac Anatomy and Function: Statistics on Fibre Architecture from DT-MRI and Registration of 4D CT Images. PhD Thesis, Nice Sophia Antipolis University, November 2009. [bibtex-entry]



3. Jean-Christophe Souplet. Évaluation de l'atrophie et de la charge lésionnelle sur des séquences IRM de patients atteints de sclérose en plaques. Thèse de sciences (PhD Thesis), Université de Nice -- Sophia-Antipolis, January 2009. [bibtex-entry]

1. Jonathan Boisvert. Modèles de la variabilité géométrique du rachis scoliotique. PhD thesis, Université de Nice-Sophia Antipolis (France) and École Polytechnique de Montréal (Canada), March 2008. [bibtex-entry]



2. Jimena Costa. Segmentation of Anatomical Structures of the Lower Abdomen using 3D Deformable Models. PhD Thesis, École Nationale Supérieure des Mines de Paris, March 2008. [bibtex-entry]



3. Pierre Fillard. Riemannian Processing of Tensors for Diffusion MRI and Computational Anatomy of the Brain. PhD Thesis, University of Nice-Sophia Antipolis, February 2008. [bibtex-entry]



4. Tom Vercauteren. Image Registration and Mosaicing for Dynamic In Vivo Fibered Confocal Microscopy. PhD Thesis, École Nationale Supérieure des Mines de Paris, January 2008. [bibtex-entry]

1. Arnaud Charnoz. Recalage d'organes intra-patient à partir de l'étude de leur réseau vasculaire : application au foie. PhD thesis, Université Louis Pasteur, Strasbourg, 2007. [bibtex-entry]



2. Olivier Commowick. Création et Utilisation d'Atlas Anatomiques Numériques pour la Radiothérapie (Design and Use of Anatomical Atlases for Radiotherapy). Thèse de sciences (PhD Thesis), Université de Nice -- Sophia-Antipolis, February 2007. [bibtex-entry]



3. Tristan Glatard. Description, deployment and optimization of medical image analysis workflows on production grids. Thèse de sciences (PhD Thesis), Université de Nice -- Sophia-Antipolis, November 2007. [bibtex-entry]

1. Vincent Arsigny. Processing Data in Lie Groups: An Algebraic Approach. Application to Non-Linear Registration and Diffusion Tensor MRI. Thèse de sciences (PhD Thesis), École polytechnique, November 2006. Keyword(s): DT-MRI, Tensors, Riemannian geometry, Lie groups, interpolation, Log-Euclidean metrics, Polyaffine transformations, Diffeomorphisms, Non-rigid registration, Multi-affine registration, Magnetic Resonance Imaging, Bi-invariant means, Fréchet means, Statistics. [bibtex-entry]



2. Olivier Clatz. Modèles biomécaniques et physio-pathologiques pour l'analyse d'images cérébrales. Thèse de sciences, École des Mines de Paris, February 2006. [bibtex-entry]



3. Hervé Delingette. Modélisation de structures déformables. Habilitation à diriger des recherches, Université Nice Sophia-Antipolis, March 2006. [bibtex-entry]



4. Guillaume Dugas-Phocion. Segmentation d'IRM Cérébrales Multi-Séquences et Application à la Sclérose en Plaques. Thèse de sciences, École des Mines de Paris, March 2006. [bibtex-entry]



5. Grégoire Malandain. Les mesures de similarité pour le recalage des images médicales. Habilitation à diriger des recherches, Université Nice Sophia-Antipolis, March 2006. [bibtex-entry]



6. Xavier Pennec. Statistical Computing on Manifolds for Computational Anatomy. Habilitation à diriger des recherches, Université Nice Sophia-Antipolis, December 2006. Keyword(s): Tensors, regularization, PDE, geometry, Riemannian geometry, Registration, statistics, manifolds. [bibtex-entry]

1. Julien Dauguet. L'imagerie post mortem tridimensionnelle cérébrale : constitution et apport pour l'analyse conjointe de données histologiques anatomo-fonctionnelles et la mise en correspondance avec l'imagerie in vivo. PhD thesis, École Centrale de Paris, June 2005. [bibtex-entry]



2. Céline Fouard. Extraction de paramètres morphométriques pour l'étude du réseau micro-vasculaire cérébral. Thèse de sciences, Université de Nice -- Sophia-Antipolis, January 2005. [bibtex-entry]



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