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Publications sur mocroscopie confocale
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Thèse de Doctorat et Habilitation |
1 - Détection de Filaments dans des images 2D et 3D; modélisation, étude mathématique et algorithmes..
A. Baudour. Thèse de Doctorat, Universite de Nice Sophia Antipolis, mai 2009.
Mots-clés : imagerie 3D, Segmentation, filaments, Deconvolution, Methodes variationnelles, mocroscopie confocale.
@PHDTHESIS{baudour2009,
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| author |
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{Baudour, A.}, |
| title |
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{Détection de Filaments dans des images 2D et 3D; modélisation, étude mathématique et algorithmes.}, |
| year |
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{2009}, |
| month |
= |
{mai}, |
| school |
= |
{Universite de Nice Sophia Antipolis}, |
| url |
= |
{https://hal.inria.fr/tel-00507520/}, |
| keyword |
= |
{imagerie 3D, Segmentation, filaments, Deconvolution, Methodes variationnelles, mocroscopie confocale} |
| } |
Résumé :
Cette thèse aborde le problème de la modélisation et de la détection des laments
dans des images 3D.
Nous avons développé des méthodes variationnelles pour quatre applications
spéci ques :
l'extraction de routes où nous avons introduit la notion de courbure totale
pour conserver les réseaux réguliers en tolérant les discontinuités de
direction.
la détection et la complétion de laments fortement bruités et présentant
des occultation. Nous avons utilisé la magnétostatique et la théorie
de Ginzburg-Landau pour représenter les laments comme ensemble de
singularités d'un champ vectoriel.
la détection de laments dans des images biologiques acquises en microscopie
confocale. On modélise les laments en tenant compte des spéci cité
de cette dernière. Les laments sont alors obtenus par une méthode de
maximum à posteriori.
la détection de cible dans des séquences d'images infrarouges. Dans cette
application, on cherche des trajectoires optimisant la diérence de luminosit
é moyenne entre la trajectoire et son voisinage en tenant compte des
capteurs utilisés.
Par ailleurs, nous avons démontré des résultats théoriques portant sur la
courbure totale et la convergence de la méthode d'Alouges associée aux systèmes
de Ginzburg-Landau. Ce travail réunit à la fois modélisation, résulats théoriques
et recherche d'algorithmes numériques performants permettant de traiter de
réelles applications. |
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