ACTION DE RECHERCHE COLOR-2000 : HORTICOL

TITRE: Controle du fonctionnement de la végétation sous serre horticole en liaison avec le risque maladie

Equipes concernées:

INRA-URIH Sophia, Centre INRA Antibes Institut National de la Recherche Agronomique/Unité de Recherches Intégrées en Horticulture
 INRIA-Sophia Antipolis Projet ORION Environnements de résolution de problèmes pour des systèmes autonomes.

1. OBJECTIF

L'objectif général est de satisfaire aux exigences de qualité de la production compatible avec le respect de l'environnement. L'action HORTICOL porte sur le couple Rosier/Oïdium qui constitue le modèle d'étude dans le cadre de l'interaction Plante/Champignon pathogène.

L'étude porte sur la faisabilité d'une détection précoce de la maladie et de l'altération des conditions de fonctionnement de la plante, en utilisant des techniques d'interprétation d'images
(traitement d'images et systèmes à base de connaissances).
Cette  étude permettra donc de mieux comprendre les conditions d'apparition de la maladie.

L'action a démarré en septembre 2000, pour une durée d'un an.
 

2. UTILISATION DES MOYENS

Le travail effectué depuis septembre a consisté à définir un système d'acquisition d'images répondant au cahier des charges suivant :
- nécessité de détecter et visualiser le réseau mycélien de l'oïdium particulièrement en début
d'attaque ( largeur caractéristique # 5 microns )

Le choix final s'est porté, après test, sur un vidéo microscope, de grossissement 100, constitué de cellules CCD couleur et comportant une sortie analogique.
Ce vidéo microscope sera couplé à un ordinateur portable de type PC.

D'autre part, un étudiant en DEA (Vincent Leclercq) a été recruté sur ce projet et prendra ses fonctions le 1er Mars 2001.
Le sujet du stage est:  "Analyse et interprétation d'images pour la détection et le suivi de pathologies du rosier"
 

3. PRINCIPAUX RESULTATS OBTENUS

Une première collection d'images d'oïdium sur rosier a été obtenue à partir d'échantillons détachés des plantes. La phase de numérisation et de visualisation de ces échantillons a été réalisée  à l'Inria. Dans l'image suivante, on voit le vidéomicroscope entre les mains de l'opérateur.

Voici l'exemple d'une image obtenue, dans laquelle on voit nettement  les traces de l'oidium:

Puis, une première tentative en vue d'une détection automatique du réseau mycélien a été effectuée
par Augustin Lux (Professeur invité chez Orion), en appliquant  des programmes de traitement d'images, afin de tester la qualité des images.
Ci-après on montre l'exemple d'un opérateur laplacien (sigma=3).




Une première conclusion est qu'il est encore possible pour un expert de l'INRA de détecter le réseau mycélien sur ces images traitées . Ce travail doit être poursuivi dans le cadre du stage de DEA de Vincent Leclercq.

4. RESULTATS ATTENDUS

La suite du travail consistera à placer le vidéo microscope dans les conditions réelles d'utilisation ( la serre ) et à acquérir des images selon un protocole à définir, dans le but de surveiller, en temps réel, l'apparition des premiers symptômes en liaison avec les paramètres microclimatiques mesurés au niveau de l'organe.

L'étape suivante comportera la mise en forme des données obtenues dans une base de connaissance précisant en particulier les conditions d'apparition de la maladie et la localisation des sites touchés préférentiellement.

Contacts:

 Paul Boissard
INRA - URIH
Route des Colles
SOPHIA-ANTIPOLIS
06410 - BIOT
email: boissard@antibes.inra.fr
tel: 04 92 96 26 57

Monique Thonnat
responsable du projet ORION
INRIA
2004 Route des Lucioles
06902 SOPHIA ANTIPOLIS Cedex
email: Monique.Thonnat@sophia.inria.fr
tel: 04 92 38 78 67