Analyse mathématique de modèles de réseaux géniques.


Lieu INRIA Sophia Antipolis
Financement: oui

Contact : Jean-Luc Gouzé, INRIA Sophia Antipolis, 2004 route des Lucioles, B.P. 93, 06902 Sophia-Antipolis Cedex.
Téléphone : 04 92 38 78 75
Courriel : gouze@sophia.inria.fr
Page web : http://www.inria.fr/comore

Des approches mathématiques et bioinformatiques sont indispensables pour analyser la dynamique des réseaux de régulation génique. Un formalisme basé sur des équations différentielles linéaires par morceaux (LPM) s'est montré particulièrement adapté pour la modélisation de ces réseaux.

Le but du stage est d'étudier le comportement dynamique des systèmes LPM (solutions, points d'équilibre, cycles limites, stabilité globale, ...) sur de petits exemples de modèles de régulation génique. Nous verrons ensuite si une telle méthodologie se transpose à des modèles plus généraux.

Des connaissances de base sont requises concernant les systèmes dynamiques non-linéaires.

Références :

de Jong, H., Gouzé, J.-L., Hernandez, C., Page, M., Sari, T., and Geiselmann, H. (2004). Qualitative simulation of genetic regulatory networks using piecewise-linear models. Bull. Math. Biol, 66:301--340.

 Gouzé, J.-L. and Sari, T. (2003). A class of piecewise linear differential equations arising in biological models. Dynamical systems, 17:299--316.


Plus d'informations sur le site http://www-sop.inria.fr/comore/arcgdyn/arcgdyn.html