Groupe de travail "Spatio-Temporel" - 2008
Buts:
- groupe de travail où l'on favorise les échanges. Pour
tous: lire les documents avant la réunion. Pour certains:
préparer la réunion et donc lire plus profondément
les documents.
- thémes:
modélisation probabiliste et inférence statistique des
phénomènes spatio-temporels en écologie notamment
forestière.
- mots-clefs (indicatif): modèles spatio-temporels en écologie, modèles individu-centrés, modèles
hiérarchiques, processus à valeurs mesure, modèles hiérarchiques et
inférence bayésienne.
- fréquence: quand on veut/peut.
Réunions:
- 26 juin 2008 (ENSAM) - Angelo Raharinirina - Un modèle markovien individu centré simple de dynamique de forêt.
- 26 juin 2008 (ENSAM) - Khader Khadraoui - Modélisation markvovienne de dynamiques agraires.
- 18 au 20 juin 2008 (ENSAM) - Colloque "Modélisation pour les Ressources Naturelles", INRA [lien]
- 30 mars au 4 avril - Rencontres Statistiques au Sommet de Rochebrune (organisation E. Parent & J.J. Boreux).
- Jeudi 27 mars 2008 à 15h00 (ENSAM/ salle 9/306 coeur d'école) Xavier Descombes (INRIA Sophia, projet Ariana) Processus Ponctuels marqués pour l'analyse d'images.
- Mercredi 20 février 2008 à 15h00 (ENSAM / salle 302 Coeur D'école) Fabien Campillo présente la seconde partie [suite et fin] du papier de Fournier & Méléard "A microscopic probabilistic description of
a locally regulated population and macroscopic approximations" 2004 [pdf]
- Mercredi 6 février 2008 à 15h00 (ENSAM / salle 301 Coeur D'école) Nicolas Desassis présente la première partie du papier de Fournier & Méléard "A microscopic probabilistic description of
a locally regulated population and macroscopic approximations" 2004 [pdf]
- Mercredi 9 janvier 2008 à 15h00 (à l'ENSAM / Coeur d'école): Bart Haegeman présente la papier de Dieckmann & Law "Relaxation Projections and the Method of Moments" 2004 [pdf] [transparents de l'exposé]
- Vendredi 7 décembre 2007 à 15h00 (à l'ENSAM / Coeur d'école): Nicolas Desassis présente la papier de Grabarnik & Särkkä "Interacting neighbour point processes: Some models for clustering" 2001 [pdf]
- Vendredi 23 novembre 2007 à 11h (à l'ENSAM / Coeur d'école): Frédéric Mortier (CIRAD) va nous parler de "Multi-scale marked area-interaction point process: a model for the spatial pattern of trees" (travail en commun avec Nicolas Picard, Avner Bar-Hen, Joël Chadoeuf)
- Pour les suivantes: on se propose de lire quelqu'uns des papiers de la bibliographie.
- Bolker, Pacala. Using moment equations to understand stochastically driven spatial pattern formation in ecological systems. Theoretical Population Biology, 1997. [pdf]
- Bolker, Pacala. Spatial moment equations for plant competition: understanding spatial strategies and the advantages of short dispersal. American Naturalist, 1999. [pdf]
- Dieckmann, Herben, Law. Spatio-temporal processes in ecological communities, CWI Quarterly, 1999. [pdf]
- Dieckmann, Law. The dynamical theory of coevolution: a derivation
from stochastic ecological processes, Journal of Mathematical Biology,
1996. [pdf]
- Donnelly, Kurtz. Particle representations for measure-valued population models. The Annals of Probability, 1999. [pdf]
- Etheridge. Survival and extinction in a locally regulated population. Annals of Applied Probability, 2004. [pdf]
- Fournier, Méléard. A microscopic probabilistic description of
a locally regulated population and macroscopic approximations. Annals
of Applied Probability, 2004. [pdf]
- Gratzer, Canham, Dieckmann, Fischer, Iwasa, Law, Lexer, Sandmann, Spies, Splechtna, Szwagrzyk. Spatio-temporal development of forests -
current trends in field studies and models, Oikos, 2004. [pdf]
- Kurtz. Particle representations for measure-valued population processes with spatially varying birth and death rates. Proceedings of International Conference on Stochastic Models (Ottawa, June, 1998) ). CMS Conference Proceedings, AMS. 1998. [pdf]
- Perkins. Measure-valued branching diffusions and interactions.
Proceedings of the International Congress of Mathematicians,
Birkhäuser, 1995. [pdf]
- Renshaw, Särkkä. Gibbs point processes for studying the development of spatial-temporal stochastic processes. Computational Statistics & Data Analysis, 2001. [pdf]
- Särkkä, Renshaw. The analysis of marked point patterns evolving through space and time. Computational Statistics & Data Analysis, 2006. [pdf]
- Dieckmann, Law, Metz. The Geometry of Ecological Interactions: Simplifying Spatial Complexity, Cambridge University Press, 2000. Table of contents.
- 1 - Introduction - Law, Dieckmann, Metz [pdf]
- Part A - Empirical and Statistical Background: A Plant Ecological Perspective
- 2 - A Neighborhood View of Interactions among Individual Plants - Stoll, Weiner
- 3 - Spatial Interactions among Grassland Plant Populations - Silvertown, Bastow Wilson
- 4 - Spatio-temporal Patterns in Grassland Communities - Herben, During, Law
- 5 - Statistical Modeling and Analysis of Spatial Patterns - Cox, Isham, Northrop
- Part B - When the Mean-field Approximation Breaks Down
- 6 - Grid-based Models as Tools for Ecological Research - Wissel
- 7 - Coexistence of Replicators in Prebiotic Evolution - Czaran, Szathmary
- 8 - Games on Grids - Nowak, Sigmund
- 9 - The Interplay between Reaction and Diffusion - Cronhjort
- 10 - Spirals and Spots: Novel Evolutionary Phenomena through Spatial Self-structuring - Boerlijst
- 11 - The Role of Space in Reducing Predator–Prey Cycles - Jansen, de Roos
- Part C - Simplifying Spatial Complexity: Examples
- 12 Spatial Scales and Low-dimensional Deterministic Dynamics - Wilson, Keeling [pdf]
- 14 Moment Approximations of Individual-based Models - Law, Dieckmann [pdf]
- 15 Evolutionary Dynamics in Spatial Host–Parasite Systems - Keeling
- 16 Foci, Small and Large: A Specific Class of Biological Invasion - Zadoks
- 17 Wave Patterns in Spatial Games and the Evolution of Cooperation - Ferrière, Michod
- Part D - Simplifying Spatial Complexity: Techniques
- 18 Pair Approximations for Lattice-based Ecological Models - Sato, Iwasa
- 19 Pair Approximations for Different Spatial Geometries - van Baalen
- 20 Moment Methods for Ecological Processes in Continuous Space - Bolker, Pacala, Levin [pdf]
- 21 Relaxation Projections and the Method of Moments - Dieckmann, Law [pdf]
- 22 Methods for Reaction–Diffusion Models - Hutson, Vickers
- 23 The Dynamics of Invasion Waves - Metz, Mollison, van den Bosch
- 24 Epilogue - Metz, Dieckmann, Law [pdf]