Dynamique évolutive d'éléments répétés du génome

1 Objet et durée de la proposition

Il s'agit d´étudier (pendant une année) la résolution analytique des équations d´équilibre issues de la modélisation comme une chaîne de Markov du processus de mutation d'éléments répétés du génome (microsatellites) afin d'améliorer la compréhension de ces modèles. La nature des ces équations les met hors des capacités des systèmes existant de calcul formel, mais certaines rentrent dans une classe d'équations pour laquelle une méthode de résolution est en cours de développement dans le projet Café.

2 Equipes participantes

Sont impliquées une équipe INRIA Sophia, une équipe CNRS du CEFE (Montpellier) et une équipe CNRS du LIRMM (Montpellier).

INRIA : Projet Café, M. Bronstein (DR INRIA).
CEFE : Equipe Génétique et Dynamique des Populations, P. Jarne (DR CNRS).
LIRMM : EquipeMéthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique, E. Rivals (CR CNRS).

Description complète de cette Color 2005 (pdf).

Stage 2005, attribué à Gregory Culianez (INSA-Toulouse), commencement début juin.